审计免疫系统论，是我国国家审计本质、职能和定位理论发展过程中的里程碑式的论述，从战略高度上确定了国家审计的本质和职能，以及在我国现代经济社会发展中的地位，为我国国家审计事业明确了长远的发展目标。
在国家审计实践中，国家审计免疫系统的本质、职能与定位，通过某些方面的特性具体表现出来，审计工作的开展，也与这些特性密不可分。笔者根据自己的审计工作实践，对国家审计免疫系统进行了深进的思考和研究，以为上述特性主要存在于独立性、综合性、系统性、预防性、惩罚性、建设性等六个方面。充分理解、把握这些特性，对于科学理解和充分发挥国家审计免疫系统的职能，在实践中做好审计工作，具有重要意义（下文中审计如无指明，均指国家审计）。
独立性
独立性是审计免疫系统的首要特性，也是使审计免疫系统区别于其他免疫系统的独特特性。它是审计免疫系统的生命线，是保证审计免疫系统职能发挥的根本保证。独立性能否发挥、发挥到什么程度，直接决定审计免疫系统职能能否发挥以及发挥的程度。
总体来看，在国家经济社会体系中，由于本身的职责与使命，审计本身是一个超越部分利益局限的监视部分。相比各微观主体和行业系统如金融、产业、农业、贸易等部分，审计在很大程度上具有独立性，在部分利益上具有较高的超然性。
从独立性的现实保证来看，我国国家审计的独立性主要体现在两个方面。首先是法律地位上的独立性。我国《宪法》第九十一条规定“审计机关在国务院总理领导下，依照法律规定独立行使审计监视权，不受其他行政机关、社会团体和个人的干涉”，从而在国家最高法律的层面赋予了审计的独立地位。《审计法》也对审计机关的权限从实际履行的层面作出了诸多保障。这些都为审计的独立性提供了法律保证。其次是经济上的独立性。目前我国在中心国家审计系统内，通过“八不准”等审计廉政制度和纪律的推行，审计机关在经费上已不依靠于被审计单位，基本切断了与被审计单位的经济联系，从而从经济上保证了审计的独立性。
在实际审计工作中，充分保证、发挥审计独立性的关键，主要在于审计廉政建设的加强和“八不准”等审计廉政纪律的严格执行。
综合性
审计不是国家经济社会体系中唯一的免疫系统，而是一种综合免疫系统或总免疫系统，甚至是免疫系统的免疫系统。从整个经济社会体系来看，在审计免疫系统之外，还存在各种类型的内部免疫系统和行业、系统免疫系统。在每个微观主体（机构主体）内部，都有内部规章制度、内部治理和监视机构等（包括内审、纪检监察机构等），这些在一定程度上发挥内部免疫的功能。在一些系统或行业内，同样存在类似的免疫系统。
审计免疫系统的综合性类似于在看病方面，作为一个综合医生，在医治病人时，不仅关注其本身的病情，及时进行对症治疗，更要关注其内部医生、固定医生对该病人的健康的维护、病患的预防、病症的医治等情况，力争从根本上保证病人肌体的健康。
在审计中，充分发挥免疫系统的综合性，就要有高度的宏观性、全局性意识，善于从经济社会发展的全局、总体的高度出发往考虑题目、开展工作、确定重点。同时，善于在审计与其他部分的联系中往发挥审计的职能，将其他免疫系统纳进到审计免疫系统中来，正确看待审计与公检法等国家其他职能部分、系统、单位的关系，并且妥善处理这些关系。
系统性
审计免疫系统的系统性，包括关注对象的系统性和关注方式的系统性。在关注对象上，具有普遍性的特点，要对国家经济社会体系、各个审计对象进行普遍关注。在关注方式上，主要是指在审计过程中，在对风险、题目进行关注时，更加注重“面”上的情况，注重从普遍性、体制性、制度性、机制性的角度往看待、分析、研究题目产生的原因以及相应的对策。